Алина Чернова: С 2009 года в Европе проведено генотипирование более 5 млн животных

Алина Чернова рассказала, как развивалась европейская экосистема геномной селекции. По ее словам, геномная селекция в животноводстве началась в Европе с 2009 года. Сейчас в этой сфере лидером является  EuroGenomics – самый большой в мире консорциум по генотипированию молочного скота. Объединение представлено в 9 странах и включает 11 лабораторий. EuroGenomics разработала свой чип на 45 тыс. маркеров, который позволяет генотипировать разные породы, в основном голштинскую, а также джерси и другие.  

Драйвером развития геномной селекции в Европе выступает Франция. Там существует федерация Eliance, которая объединяет 126 кооперативов, занимающихся селекцией, разведением скота и консультированием.

Eliance основала компанию Valogene, которая по сути является дата-центром и занимается анализом данных для Франции. Работа происходит по следующей схеме – та или иная ферма собирает образцы ткани (это могут быть волосы, кровь и так далее) и отправляет их в лабораторию.

Результаты анализа поступают в Valogene, которая активно сотрудничает с научными организациями Франции и ведет свою базу данных. В свою очередь, Valogene публикует геномные оценки раз в неделю и дает компаниям рекомендации по менеджменту.

Первоначально анализы для сельхозпроизводителей в Европе проводились бесплатно, сейчас – на платной основе. Вместе с тем даже платное генотипирование выгодно для фермеров, отметила Алина Чернова. По ее словам, недавно было опубликовано исследование, в котором сказано, что затраты фермеров на проведение геномного теста окупаются.

Как отметила Алина Чернова, по похожему принципу развивается генотипирование и в США, там в этой сфере работает компания CDCB. С начала ее работы с 2008 года было прогенотипировано более 5 млн животных.

Генотипирование хорошо работает для крупного, а также мелкого рогатого скота, сказала Алина Чернова. Например, объединение Capgenes активно занимается генотипированием мелкого рогатого скота. Существует и геномная селекция овец. В этой сфере, например, с 2014 года работает компания Ovigen из Ирландии.

Совсем недавно началось генотипирование лошадей, рассказала Алина Чернова. Этим занимается, в частности, объединение Equine Genetic Diversity Consortium.

Что касается экзотических видов животных, то недавно грант компании Illumina выиграл итальянский верблюжий консорциум. Они провели полное секвенирование и создали базу данных по генетическому разнообразию верблюдов.

Кроме того, развивается геномная селекция и в растениеводстве. Так, ведется селекция пшеницы в части увеличения ее устойчивости к засухе, рассказала Алина Чернова.